MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 463

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	TTTC	2	8	40	47	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013453	CT	3	6	89	94	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013453	TCA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013453	T	6	6	111	116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013453	TCT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260516
6	NC_013453	ATA	2	6	183	188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260516
7	NC_013453	TAG	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260516
8	NC_013453	TAAA	2	8	395	402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013453	A	6	6	453	458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013453	A	8	8	478	485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013453	TCT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013453	GAAT	2	8	511	518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013453	AAT	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013453	ATT	2	6	610	615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013453	ATA	2	6	619	624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013453	CAA	2	6	630	635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013453	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013453	AGT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013453	AGGATA	2	12	718	729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013453	AAG	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013453	A	6	6	844	849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013453	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013453	ATTA	2	8	870	877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013453	GAT	3	9	879	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013453	ATT	2	6	888	893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013453	AAT	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013453	TATGG	2	10	1038	1047	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013453	AT	3	6	1115	1120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013453	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013453	TA	3	6	1155	1160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013453	GA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013453	T	6	6	1215	1220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013453	TAG	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013453	TAT	2	6	1255	1260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013453	ACT	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013453	ACT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013453	TA	4	8	1287	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013453	AT	3	6	1323	1328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013453	TAA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
40	NC_013453	TA	3	6	1394	1399	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
41	NC_013453	TA	3	6	1415	1420	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
42	NC_013453	AGTG	2	8	1421	1428	25 %	25 %	50 %	0 %	262260517
43	NC_013453	CAA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260517
44	NC_013453	TTTC	2	8	1482	1489	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
45	NC_013453	TA	3	6	1517	1522	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
46	NC_013453	CTTT	2	8	1524	1531	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
47	NC_013453	T	6	6	1529	1534	0 %	100 %	0 %	0 %	262260517
48	NC_013453	ATA	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
49	NC_013453	GAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260517
50	NC_013453	AACA	2	8	1730	1737	75 %	0 %	0 %	25 %	262260517
51	NC_013453	T	6	6	1826	1831	0 %	100 %	0 %	0 %	262260517
52	NC_013453	CCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260517
53	NC_013453	CTT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
54	NC_013453	AAT	3	9	2059	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
55	NC_013453	CTT	2	6	2131	2136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
56	NC_013453	AAT	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
57	NC_013453	CTA	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260517
58	NC_013453	CTTT	2	8	2407	2414	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
59	NC_013453	TACA	2	8	2480	2487	50 %	25 %	0 %	25 %	262260517
60	NC_013453	AAGCT	2	10	2524	2533	40 %	20 %	20 %	20 %	262260517
61	NC_013453	TCA	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260517
62	NC_013453	CTTA	2	8	2660	2667	25 %	50 %	0 %	25 %	262260517
63	NC_013453	AAT	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
64	NC_013453	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
65	NC_013453	AAT	2	6	2738	2743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
66	NC_013453	TTA	2	6	2772	2777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260517
67	NC_013453	TTA	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260517
68	NC_013453	CCT	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013453	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013453	AGT	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013453	TCT	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013453	AAT	2	6	3099	3104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013453	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013453	T	6	6	3231	3236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013453	T	7	7	3243	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013453	AAT	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013453	AAAT	2	8	3307	3314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013453	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260518
79	NC_013453	CTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
80	NC_013453	T	6	6	3435	3440	0 %	100 %	0 %	0 %	262260518
81	NC_013453	AT	3	6	3464	3469	50 %	50 %	0 %	0 %	262260518
82	NC_013453	TAT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260518
83	NC_013453	CTT	2	6	3491	3496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
84	NC_013453	TG	3	6	3499	3504	0 %	50 %	50 %	0 %	262260518
85	NC_013453	CTT	2	6	3507	3512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
86	NC_013453	CCTT	2	8	3515	3522	0 %	50 %	0 %	50 %	262260518
87	NC_013453	TAA	2	6	3549	3554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260518
88	NC_013453	TCAT	2	8	3562	3569	25 %	50 %	0 %	25 %	262260518
89	NC_013453	T	6	6	3571	3576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013453	C	6	6	3577	3582	0 %	0 %	0 %	100 %	262260519
91	NC_013453	TAT	2	6	3665	3670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260519
92	NC_013453	ACATA	2	10	3680	3689	60 %	20 %	0 %	20 %	262260519
93	NC_013453	CGCC	2	8	3718	3725	0 %	0 %	25 %	75 %	262260519
94	NC_013453	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260519
95	NC_013453	TTCT	2	8	3767	3774	0 %	75 %	0 %	25 %	262260519
96	NC_013453	TTA	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260519
97	NC_013453	CAT	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260519
98	NC_013453	ACTT	2	8	4026	4033	25 %	50 %	0 %	25 %	262260519
99	NC_013453	TAA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260519
100	NC_013453	TTG	2	6	4103	4108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260519
101	NC_013453	TG	4	8	4180	4187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013453	T	6	6	4215	4220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013453	TC	3	6	4238	4243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013453	T	6	6	4392	4397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013453	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013453	AT	3	6	4421	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013453	ACA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013453	AT	3	6	4540	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013453	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013453	TAT	2	6	4592	4597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013453	TA	3	6	4646	4651	50 %	50 %	0 %	0 %	262260520
112	NC_013453	A	7	7	4660	4666	100 %	0 %	0 %	0 %	262260520
113	NC_013453	AGG	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262260520
114	NC_013453	TGT	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260520
115	NC_013453	ATC	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013453	A	6	6	4830	4835	100 %	0 %	0 %	0 %	262260521
117	NC_013453	TTG	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260521
118	NC_013453	GTC	3	9	4928	4936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260521
119	NC_013453	GAT	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260521
120	NC_013453	AT	3	6	5063	5068	50 %	50 %	0 %	0 %	262260521
121	NC_013453	AT	3	6	5135	5140	50 %	50 %	0 %	0 %	262260521
122	NC_013453	T	6	6	5146	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	262260521
123	NC_013453	AG	3	6	5174	5179	50 %	0 %	50 %	0 %	262260521
124	NC_013453	ATCAT	2	10	5258	5267	40 %	40 %	0 %	20 %	262260521
125	NC_013453	A	6	6	5279	5284	100 %	0 %	0 %	0 %	262260521
126	NC_013453	ATC	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260521
127	NC_013453	GAT	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260521
128	NC_013453	A	6	6	5394	5399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013453	AAT	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013453	TCCAA	2	10	5435	5444	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_013453	AAT	2	6	5469	5474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013453	CTA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013453	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260522
134	NC_013453	A	7	7	5583	5589	100 %	0 %	0 %	0 %	262260522
135	NC_013453	A	6	6	5601	5606	100 %	0 %	0 %	0 %	262260522
136	NC_013453	TATT	2	8	5626	5633	25 %	75 %	0 %	0 %	262260522
137	NC_013453	AAT	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260522
138	NC_013453	TTA	2	6	5748	5753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013453	TAG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013453	GTT	2	6	5804	5809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013453	TAT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013453	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013453	ATC	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013453	TAA	2	6	5866	5871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013453	GGAA	2	8	5881	5888	50 %	0 %	50 %	0 %	262260523
146	NC_013453	TAA	3	9	5890	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260523
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282	NC_013453	CAA	2	6	10894	10899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260529
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461	NC_013453	AAT	2	6	17168	17173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_013453	GCA	2	6	17185	17190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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